あれから色々調べてみたのですが
トランスコードをEncoreからかけずに「環境設定」ー「一般」の
Adobe MediaEncoderアプリケーションを使用してアセットをトランスコード
にチェックをいれてAdobe MediaEncoderのほうに仕事をさせたら
サクサクエンコードがかかりました。
XMPを読み込み中というところで止まったりしましたが
どのファイルが原因で止まるかわかるので
止まったファイルに関してはPremireから新規シーケンスを作成して
コピペで移植することで進行するようになりました。
上記を参考にしました。
Encoreのトランスコードはどのみち遅くて使い物になりませんね。
何故MediaEncoderと同じシステムを取り入れないのだろうか・・・
ありがとうございました。