こんばんは
要約すると、次のようなことでしょうか。
Windows 10環境下で、Premiere Pro CS5の編集結果をDynamicLink経由でEncore CS5に送信し、メニュー付きBlu-rayディスクを何度も焼くことが出来ていた。
ところが、今回焼いたBlu-rayディスクを再生すると、ご提示のような症状を呈した。Encoreのプレビュー時ではこのような症状は出ていない。また「プロジェクトをチェック」では問題 なかった。
思いつくところを書いてみます。
①以前焼いた正常なBlu-rayディスクを再生してみてください。
⇒ご提示のような症状を呈した場合は、レコーダー（またはプレーヤー）のトラブルと思います。
⇒呈しない場合は、Encoreの問題ではと思います。
②Encoreの問題としても、動作保証対象外ですので、Windows 10の更新等でプログラムが更新されたのが原因で正常に焼くことが出来なくなった可能性もあります。
③キャッシュメモリーを削除してみます。
下記リンクの指示に従って、行ってみてください。Windows 10はWindows 7と同じです。Commonフォルダー階層下のMedia CacheとMedia Cache Files両フォルダー内のファイルを削除します。EncoreとPremiere Proとで共通のフォルダーです。
ハードディスクの空き領域が徐々に減っていく （Premiere Pro/Encore）
④Dynamic Linkを使わず、m2tファイルで書き出して試してみます。
m2tファイルの書き出し方法は、下記リンク（当フォーラムの投稿です）の最後の私の書き込みからダウンロードできる「書き出し設定」マニュアルに記載されていますのでご覧になってください。
⑤アンインストール→再インストールを試してみます。
アンインストールする前にEncoreとPremiere Pro両方で「ライセンス認証の解除」（メニューの「ヘルプ」の中にあります。）を行います。
再インストールはPremiere Proをインストールすると、Encoreは自動的にインストールされます。再インストールの最初の頃に「環境設定何とか」が表示されたら、「環境設定を引き継がない」にしてください。